芽孢桿菌可以降低水體中硝酸鹽、亞硝酸鹽的含量，從而起到改善水質的作用。還能與養(yǎng)殖環(huán)境中的有害藻類以及各種致病菌競爭，形成優(yōu)勢種群，從而能夠有一定的抑制作用。

芽孢桿菌的使用：        

建議晴天上午或者中午的時候使用，最好同時能夠有風、有波浪。  切記：陰雨天、天氣悶熱的時候解決不能使用芽孢！這種天氣塘口本身就容易缺氧，加之使用芽孢桿菌后會加速缺氧情況的發(fā)生！ 枯草芽孢桿菌的使用方法枯草芽孢桿菌在水產養(yǎng)殖中有兩種使用方法，一種是凈水用，另一種是內服。

1、凈水用；這是絕大多數(shù)芽孢桿菌的使用情況，也是最常見的?？莶菅挎邨U菌能大量消耗水體中的有機質，將其分解為小分子有機酸、氨基酸及氨，改善水質，為單胞藻提供營養(yǎng)，能夠分解各種有機質，綜合凈化水環(huán)境，改善不良水質。

2. 內服使用；即添加到飼料中給水產動物食用，其實很多很多內服制劑以及飼料中也添加芽孢制劑。可以改善魚蝦蟹的腸胃功能，提高飼料的利潤率，改善肉質，促進長生，防病效果很好。主要是靠芽孢桿菌的占位效應，還有就是能夠產生有益代謝產物。